Посмотрите стандартный Update Toolkit для Navision. Точно знаю, что есть инструменты для конвертирования данных с 3.01 на 4.0, насчет 2.0 --> 4.0 не уверен. Кста, логика Navision прилично изменилась с 2.0 до 4.0, Галина абсолютно права.

А если база еще и сильно кастомизирована - то тут сам процесс подготовки инструментария для переноса данных может занять много времени.
ЗЫ. А в каком институте пишут такие дипломные работы? Неужто научный руководитель - сотрудник компании, связанной с Navision?