Планировать с отрицательным кол-вом не даст. При настройке системы надо указать, что филе может создаваться только начала производсва разделки рыбы (и еще очень много чего). Тогда возможно при начале пр-ва "Разделка рыбы" -> включить "ссылки" - автоматом запуститься производство "мариновка филе".
А вообще - то стоит сначала попробовать из костей, потрохов и филе рыбу собрать

даст понимание производства и поможет во многом разобраться, надеюсь.
Если что-спрашивайте, постараюсь помочь.