по-моему, просто не доработали АВТОМАТИЧЕСКОЕ распределение.
Понятно, что внучную можно проставить нужные суммы к нужным строчкам. Но это долго.
Такая же проблема возникает, когда несколько заказов приходят в одном контейнере и накладной расход надо распределить на несколько заказов, а не на один.
Тут, наверное можно делать модификацию в алгоритм распределения (действие можно сделать и руками, модфикация вводит только удобство).
И, насколько понимаю, возможность расширения была заложена изначально. Например, добавляется распределение по весу, объему или нескольким заказам. Насколько я понимаю, в данном случае, они просто не парились особо накладными расходами. Иначе были бы сделаны еще и накладные расходы на складские перемещениея