Если у вас первоисточником строк в wmsOrderTrans являются только маршруты комплектации(или будут являться только они), то можно смело добавлять условие по полю RouteId
X++:
wmsOrderTrans.routeId == inventTrans.PickingRouteID
Все зависит от функциональности, которую будете использовать сейчас и планируете использовать в дальнейшем.