Проверьте складскую аналитику.
Почти наверняка система требует ту аналитику, для которой нет доступных номенклатур.
Например: если вы отгружаете (комплектуете) номенклатуру с обязательным указание серийного номера, а такового на складе нет, есть только с аналитикой склад.
Или Ячейка - товар в наличии с аналитикой склад, а для комплектации требуется чтобы он находился в Ячейке.
Это лишь догадки, конечно всё нужно проверять в каждом конкретном случае
