[Ivanhoe]

Давайте разберемся. Отгрузочная накладная идет по Продаже, а не по Закупке. Говорим все-таки про продажу? Отгрузочную, возможно, надо зарегистрировать (кнопка Регистрация отгрузочной доступна?).

1. В форме регистрации отгрузочных накладных есть отмена отгрузочных.
2. Можно спокойно разнести отборочную после отгрузочной (проверьте параметр количества в форме разноски - поменяйте на "Скомплектовано"). Если это стандартная система и отгрузочная уже зарегистрирована.
3. Можно вручную по каждой строке заказа на продажу нажать Запасы - Комплектация и вручную отменить комплектацию (работает после регистрации отгрузочной).