Ошибку корреспонденции походе удалось исправить, модифицировав код метода importTransactions класса rtslLedgerTranslation.
X++:
protected void importTransactions()
{
....
while select tmpLedgerTrans // The order defines bond sequence
order by Voucher,
TransDate,
//BUG003, 10/10/2012 -->
//add - исправление ошибки корреспонденции
BondBatch desc,
BondBatchTrans desc, // 2-2, 1-1, 0-0, 0, 0, 0
//BUG003 <--
TransType,
OperationsTax,
AccountType, // Usial-Usial, Usial-Disbalance, ...-TransDiff
Txt
//BUG003 10/10/2012 -->
//comment - исправление ошибки корреспонденции
//BondBatch desc,
//BondBatchTrans desc // 2-2, 1-1, 0-0, 0, 0, 0
//BUG003 <--
...На такой вариант удалось выйти почти случайно, просто по косвенным признакам я пришел к выводу, что если количество проводок большое и пара ДТ - КТ приходит не последовательно в движок корреспонденции, то он затрудняется их обработать.
После внесения описанных выше изменений ошибка перестала проявляться.