погоди, bucken.
Так не спрашивают.
Ты расскажи, что у тебя 2.5
Ты скажи, что у тебя включены виртуальные компании (или уже выключены?)
Если выключены, то расскажи о том, делели ли вы копирование номенклатуры
А также какие таблицы входят в коллекции (хотя бы номенклатурные)
и скажи какие компании в какие виртуальные компаниии входят;
Если же ты спрашиваешь о стандартной функциональности

то в стандартной функциональности так и должно быть.