В целом механизм получился такой:
1) Заливаем области;
2) Заливаем районы;
3) Заливаем города с областями (с разрешением дублирования);
4) Делаем экспорт городов;
5) Готовим пачку файлов по областям (из-за ограничения в 8mb на файл). Если названия районов не дублируются, то можно по названиям, а для дублирующихся указываем их GUID;
6) Заливаем города по областям.
Получаем необходимый результат.
В выше описанном случае много лишних телодвижений получается.
Но вообще говоря, хотелось бы, чтобы был простой механизм увязывания имен района и области, как, например в SELECT ... WHERE Район='Название' AND Область='Название'
В любом случае всем огромное спасибо за участие