Если компенсация за использование личного автомобиля - фиксированная сумма, можно поробовать настроить отражение таких расходов через авансовый отчет через нормы расходов, в расходе указать сумму по норме и настроить разноску для нормативных сумм и сверхнормативных сумм (настраивается счет ГК и аналитика). А в регистр потом, я думаю, соберёте...
