А не проще ли переписать отчеты через "прямые" SQL-запросы непосредственно из АХ, через SSRS или другой отчетник ? При грамотной реализации они будут выполнять значительно быстрее, нежели при варианте с копией.
Если уж очень хочется реплицировать, то определите список таблиц, требуемых для ваших отчетов и гоняйте только его. Если перетаскивать все таблицы, то можно нарваться на системные, которые изменяются даже при запуске и выполнении отчетов, например SysLastValue.
Если в них просходит изменение структуры, то придется переливать полный бэкап, для 50Гб это должно занять в районе получаса на нормальном железе.
PS. Синхронизация приложений на разных АОСах у меня вызывает очень большие сомнения из-за непонятного кэширования
