Раньше (во времена 2.5) проверки на уникальность меток не было. Дублирующиеся метки, видимо, с тех времен остались. Есть три способа сделать то, что вы хотите: один - человеческий, два - программерские
- (человеческий) Пишите уникальные комментарии.
- Добавляйте какую-нибудь кривую метку, а потом редактируйте ее руками в ALD-файле. Там уж на уникальность у вас ее никто не проверит.
- В методе SysLabelEdit::labelInsert() исправьте 11 и 13 строчки, а в методе SysLabelEdit::labelModify() - 23 и 25. Как исправить, надеюсь, догадаетесь сами.