Каюсь, я немного поспешил
Для начала можно попробовать пересчитать сальдо по периодам.
Еще можно пересоздать открывающие/закрывающие проводки.
Если не поможет, то попытаться найти в инфологе счет, который дает расхождение и попытаться с ним разобраться.
Ну и напоследок изучать операцию закрытия налогового периода.