В корреспонденции с "левым" счетом. Журнальчиком ГК.
А по материалам складским журналом.
И по контрагентам журналом же, только в корреспонденции с контрагентами.
Веселее же всего с НДС - тут простор для творчества в зависимости от того, хотим ли мы головняк сразу или потом
Теоретически хорошо бы вводить задолженность по контрагентам фактурами, сразу с НДС. Если возможно