1. Вариант без доработок (как и писали выше) - настройка стандартных оповещений.
2. Вариант с доработкой: не сочитите за рекламу моего проекта (он для 4.0), но, возможно, поможет:
Проект расширения стандартных оповещений AX 4.0
В частности, там есть доработка, позволяющая создавать оповещения программно и на их основе делать почтовые сообщения с возможностью перехода. Реализация основана на стандартных оповещениях и письмах. В 2009 появилось семейство классов EventNotification, несложно сделать своего наследника и вызывать его по нужному событию - также получите стандартное оповещения и письмо на основе его.
Еще про оповещения и почту можно почитать в хелпе (4.0 - для администратора, 2009 - по настройке системы и приложения), там целые разделы по оповещениям.