ГФО не умеет делать новые строки, он только пробивает указанные ячейки.
Настроить можно по всему списку аналитик, но при добавлении нового нужно будет в шаблон и настройку ГФО добавить строки.
Так же в ГФО АХ4 сп2хф (не помню от лета 2008) добавили в ГФО новых фич.
Теперь он может строить данные (строго числовые - суммы или колво) по любой таблице - настраивается как запрос (типа автоотчета с сумматором по полю при наложеном фильтре).
То есть, теперь можно и клиентов и номенклатуру выводить, но опять же штучно, не автосписком, перечисляя в шаблоне ВСЕ нужные позиции.
Если в условиях задачи стоит строго по ГК, то делаем так
В шаблоне настраиваем свернутое по счету сальдо, общей суммой, а далее пишем "в том числе" - и там выводим нужные срезы аналитик по строчкам.
А вообще, это все лечится оборотно-сальдовой ведомостью в разрезе аналитик, где все само схлопывается и расхлопывается. Я такой сделал еще в 2003 году и от колва версий (с ах 2.5) он даже не устарел
, апдайтил пару раз при переносе.